analyse-R/analyse-de-sequences

[utterances-bot]

Analyse de séquences

http://larmarange.github.io/analyse-R/analyse-de-sequences.html

[elosch]

Bonjour,
Je dispose d'un tableau de données quantitatives dont les variables sont les jours d'un mois (donc variables dépendantes les unes des autres). L'idée est de classer les individus, donc je pensais à une classification ascendante hiérarchique avec analyse de séquences, mais vu que mes variables sont déjà quantitatives, je n'ai pas envie de créer artificiellement des séquences en fonction de valeurs seuils et de perdre de la précision...
Y-a-t-il des distances tenant compte directement de variables continues ?
Merci d'avance pour votre réponse !

[larmarange]

L'analyse de séquences ne permets pas la prise en compte de variable continue. Pour cela, vous pouvez regarder du côté des modèles mixtes à classes latentes. Un exemple rapide est visible sur http://larmarange.github.io/analyse-R/trajectoires-de-soins.html#mod%C3%A8le-mixte-%C3%A0-classes-latentes

[elosch]

Merci beaucoup pour votre réponse, je regarde ça !Bonne soirée -------- Original message --------From: Joseph <[email protected]> Date: 4/27/20 11:41 (GMT+01:00) To: larmarange/analyse-R <[email protected]> Cc: elosch <[email protected]>, Comment <[email protected]> Subject: Re: [larmarange/analyse-R] analyse-R/analyse-de-sequences (#118) L'analyse de séquences ne permets pas la prise en compte de variable continue. Pour cela, vous pouvez regarder du côté des modèles mixtes à classes latentes. Un exemple rapide est visible sur http://larmarange.github.io/analyse-R/trajectoires-de-soins.html#mod%C3%A8le-mixte-%C3%A0-classes-latentes —You are receiving this because you commented.Reply to this email directly, view it on GitHub, or unsubscribe. [ { "@context": "http://schema.org", "@type": "EmailMessage", "potentialAction": { "@type": "ViewAction", "target": "#118 (comment)", "url": "#118 (comment)", "name": "View Issue" }, "description": "View this Issue on GitHub", "publisher": { "@type": "Organization", "name": "GitHub", "url": "https://github.com" } } ]

[CarolineORSBFC]

Bonjour,
j'ai un message d'erreur concernant la longueur négative de vecteurs (cf ci-dessous), quand je lance la fonction seqdist.
Savez-vous d'où le problème peut venir ? Peut-être de la volumétrie des données ?
Si vous avez une idée, je suis preneuse ! Merci d'avance

dist_soins <- seqdist(seq_soins, method = "OM", sm = couts, indel = 1.5)
[>] 83397 sequences with 5 distinct states
[>] checking 'sm' (one value for each state, triangle inequality)
[>] 15305 distinct sequences
[>] min/max sequence length: 13/13
[>] computing distances using the OM metric
Erreur dans seqdist(seq_soins, method = "OM", sm = couts, indel = 1.5) :
longueur de vecteurs négative non permise

Caroline Bonnet

[larmarange]

Bonjour,

je ne suis jamais tombé sur ce message d'erreur. Le mieux serait de demander conseil directement à l'équipe qui a développé TraMineR.

cf. http://traminer.unige.ch/contrib.shtml

[CarolineORSBFC]

Merci beaucoup ! Je vais tenter de contacter l'équipe...