GitHub - marco315176/Analisis_de_Genomas_Bacterianos: Análisis de genomas bacterianos obtenidos por secuenciación de genoma completo con Illumina

Pipeline diseñado para el análisis de genomas bacterianos obtenidos por secuenciación de genoma completo con Illumina

Name		Name	Last commit message	Last commit date
Latest commit History 21 Commits
AMRFinder.sh		AMRFinder.sh
Estadisticos_ensamble_bacterial.sh		Estadisticos_ensamble_bacterial.sh
MLST.sh		MLST.sh
Nombres_tsv.sh		Nombres_tsv.sh
README.md		README.md
SPAdes_bacterial.sh		SPAdes_bacterial.sh
Trimmomatic.sh		Trimmomatic.sh
TrimmomaticPE.sh		TrimmomaticPE.sh
estadisticas_lecturas_bacteria.sh		estadisticas_lecturas_bacteria.sh
find_files.sh		find_files.sh
kSNP4.sh		kSNP4.sh
kmerfinder_bacteria.sh		kmerfinder_bacteria.sh
kraken2_bacterial.sh		kraken2_bacterial.sh
metaSPAdes_bacterial.sh		metaSPAdes_bacterial.sh
pipeline_bacteria.sh		pipeline_bacteria.sh
resfinder.sh		resfinder.sh
results_bacteria.sh		results_bacteria.sh
seqsero2.sh		seqsero2.sh
serotypefinder.sh		serotypefinder.sh
spoligotyper.sh		spoligotyper.sh
stringMLST.sh		stringMLST.sh
vSNP3_spoligo.sh		vSNP3_spoligo.sh

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